Die Mündung der Isar ist in mehrfacher Hinsicht eine Besonderheit. Sie ist in Deutschland die einzige naturnah erhaltene Mündung eines Voralpenflusses in die Donau, sie wird großflächig von noch naturnahen Auen gesäumt und sie liegt am letzten frei fließenden Abschnitt der Donau in Deutschland. Der Reichtum an Strukturen und Habitaten verleiht ihr eine herausragende naturschutzfachliche Bedeutung und hat zur Ausweisung als Naturschutzgebiet und FFH-Gebiet geführt. Diese besondere Bedeutung für den Naturschutz war auch der Grund für die Aufnahme in das Förderprogramm des Bundes zur „Errichtung und Sicherung schutzwürdiger Teile von Natur und Landschaft mit gesamtstaatlich repräsentativer Bedeutung“. Das Naturschutzgroßprojekt „Mündungsgebiet der Isar“ wurde in Zusammenarbeit zwischen dem Bund, dem Freistaat Bayern und dem Landkreis Deggendorf durchgeführt. Ziel des Vorhabens war die Erhaltung und Wiederherstellung einer weitestgehend intakten, naturnahen Überflutungsaue und die Regeneration natürlicher Auenökosysteme mit naturnahen Auenwäldern, Auengebüschen, Staudenfluren, Wasserpflanzen- und Röhrichtgesellschaften, offenen Kies- und Sandbänken sowie natürlichen Sukzessionsabläufen. Parallel zu dem Naturschutzgroßprojekt wurde ein Forschungs- und Entwicklungsvorhaben durchgeführt, das ökologisch-naturwissenschaftliches Wissen für eine optimale Gestaltung der Maßnahmen im Gebiet der Isarmündung erbringen sollte. Dabei wurden Daten erhoben, die nicht nur für die Durchführung des Naturschutzgroßprojektes wichtig waren, sondern in Zukunft auch eine wertvolle Grundlage für die Erforschung von Auenlebensgemeinschaften und ihren Umweltbedingungen darstellen werden. Der Deutsche Bundestag beschloss 2002, den Bereich der Donau zwischen Straubing und Vilshofen, in dem auch die Isarmündung liegt, ohne Staustufe für die Schifffahrt auszubauen. …